Instalasi Farmasi di Rumah Sakit Tk. II dr. Soepraoen terbagi menjadi beberapa Depo Farmasi :
- Depo 1 (Khusus untuk pasien swasta)
- Depo 2 ( Khusus untuk Rawat Inap )
- Depo 3 ( untuk pasien rawat jalan dan untuk anggota TNI yang berobat jalan di RS kami sediakan Depo sendiri disamping Depo 3)
- Depo 4 ( adalah Depo khusus untuk OK sentral dan OK Gyn)
- Depo 5 ( Depo khusus di ICU)
- Depo 6 ( Depo yang khusus untuk pasien Hemodialisa)